On a small island in the Florida Everglades, a DEA agent and a local sheriff gather a team of locals to take down a giant meth-fueled alligator.

A quartet of humanoid turtles, trained by their mentor in ninjitsu, must learn to work together to face the menace of Shredder and the Foot Clan.

The Turtles and the Shredder battle once again, this time for the last cannister of the ooze that created the Turtles, which Shredder wants to create an army of new mutants.

The four turtles travel back in time to the days of the legendary and deadly samurai in ancient Japan, where they train to perfect the art of becoming one. The turtles also assist a small village in an uprising.

本片叙述了一个叫做Kidd Video的四人加利福尼亚的青年演唱组合的惊奇卡通之旅。一天，他们在一个旧货仓库彩排表演。突然，四人身边的一面镜子里现出了图像，一个叫做Master Blaster的卡通人物出现在镜中，他按动了椅子上的按钮，把整个乐队带到了一个摇滚的世界，这是一个被称作弗里卜塞德的世界。这是一个兴旺的，没有威胁的世界，到处都是Kidd Video乐队的FANS。这是一个光怪陆离的世界，所有的自然法则都不存在。乐队四人全部变成了卡通人物，Master Blaster想把乐队变成他永远的音乐奴隶！然而，四个孩子被一个叫Glitter的精灵所救。在片中，四人乐队在弗里卜塞德的世界中，既要寻找回到人类世界的道路，还要躲避Master Blaster和他的亲信Copy Cats （拷贝猫）的追踪。
“你们听着，我要把你们统统地送到弗里卜塞德去。哈哈！”“出了什么事，哎呀，真奇怪，啊，我们到了动画世界。哦，天啊！”“哈哈，你们永远做我的音乐奴隶吧。”“这里面是什么，我来救你们……哎，，阿啑”“这是怎么回事呀，让我们漫游一番吧，走！”（开场白）