EVANGELION: 3.0 (-46h) is an original video animation (OVA) included as a bonus feature with the DVD and Blu-ray release of Evangelion: 3.0+1.0 Thrice Upon A Time on 08 March 2023, the two-year anniversary of the film's initial theatrical release. It was announced on 04 October 2022 and included on a separate disc together with a video re-release of the anime short EVANGELION: 3.0 (-120 min.)

收录于DVD中的特典剧场。以Q版的人物形象和小品的形式，讲述了《蓝宝石之谜》TV版的补充资料和人物趣闻，非常有意思的“补完”企划。包括舰船资料、人物性格、鹦鹉螺号22话后发生的故事以及新亚特兰蒂斯王国的资料等。更有女主角娜蒂亚的绝美照片。

　　突袭世界的大灾难“第二次冲击”后，世界在废墟之上重建。14 岁的少年碇真嗣被父亲碇元渡叫到第三新东京市。本以为能见到父亲迎接的他，却见到名为“ 使徒”的巨大生物与军队交火。危急之下，特务机关 NERV 的葛成美里将真嗣救下，并将其带往碇元渡所统领的 NERV 总部。但迎接真嗣的，却是是父亲冷酷地命令：驾驶称为“EVA”的巨大人型机器人与使徒战斗。本已表示拒绝的真嗣，看到重伤的替补驾驶员绫波丽后，决定遵从父亲的命令。就这样，从未受过作战训练的真嗣，准备驾驶 EVA 初号机迎战使徒。 不断袭来的使徒，身份不明的绫波丽，从德国来的驾驶员惣流·明日香·兰格蕾，14 岁的少年要面对远超自己能力的挑战。而碇元渡不动声色地观察一切，一个称为“人类补完计划”的神秘计划正在按照他的计划实现。