该片主要讲了超星特工猪猪侠在上次的任务中留下了后遗症，但他坚持独自潜入海底世界执行新任务。在五彩缤纷的海底世界见识到各种各样的海底生物，结识了正在寻找哥哥的小豆芽，受小豆芽勇敢执着的精神所打动，猪猪侠决定帮助小豆芽，帮他一起寻找哥哥。原来海洋世界发生了一件不为人知的大事，导致大量海洋“居民”失踪。的故事。

　　以阿五寻找猪猪侠为开端，讲述了见习超星特工阿五前往恐龙世界，结识了性格各异的伙伴们，在旅途中大家遭遇恶劣环境、恐龙袭击等种种危机，最后能够勇敢直面自己的弱点，相信伙伴的力量，从中得到了成长。