城市中出現了來歷不明的光病毒。SRC中的Eyes隊成員為要確認光源搜尋至鏑矢島，遇上了對怪獸充滿愛心的預備飛行員春野武藏。此時，光病毒入侵怪獸力特里亞斯體內，力失控，Eyes準備向力發動攻擊，武藏決要阻止，危急中，超人高斯終於回來。

近未来，人类科技高度发达，一款名为加拉金的智能机器人得到开发。一时间全国风靡，人手一款。未过多久，一个体型堪比东京铁塔的庞大外星生物降临地球，它形貌类似加拉金，连续多日站在东京塔旁，却迟迟没有任何举动。30岁的流行杂志《MND》记者坂本刚一（袴田吉彦 饰）和自由摄影师楠木凉（远藤久美子 饰）展开调查，终于揭开了外星人和加拉金之间的秘密。以此为契机，坂本和楠木又卷入了一系列离奇诡异的事件中，如涂鸦神秘符号的外星人、明明已经死去又重新出现的同学、生活在拼图中的女人、凭空消失的女主播等等。
这个世界上，的确存在着许多你我所不知道的领域和事件……

本作的主人公是在光中消失的宇航飞行员的儿子。当时的他还和他的父亲约定回来看他打棒球，在此时他却从戴民长官那里得知了噩耗。

但传说战士长大之后加入了地球和平联合组织TPC，最初他在宇宙发射中心工作，后进入SUPER GUTS（超级胜利队）的学员训练班。在一次模拟战争中一举击败了SUPER GUTS的王牌飞行员由美村良，然而此时他却遇到了宇宙球体“斯菲亚”，虽然他奋力战斗，却寡不敌众。此时他看见了神秘的光，突然成为了戴拿奥特曼的人间体。当他清醒过来时，已经莫名其妙地成为了SUPER GUTS的队员了，是由美村举荐了他。

在火星的一次战斗中，斯菲亚与岩石合体，变成了怪兽。传说英雄在和它战斗时，身陷险境，此时他的身体发出闪亮的光。这时，他变成了新的光之巨人，以强大的实力击败了达兰比尔。当他恢复回原来的样子时，他的脚边出现了神秘的变身器——闪光剑。

之后超级胜利队的绿川麻衣给这个新的奥特曼起名“戴拿奥特曼”，光之巨人的故事开始了。

21世纪，地球回复昔日的和平，但此时宇宙坠下一颗陨石，陨石有一个人工的时空囊。地球和平联盟TPC的GUTS小队通过时空囊了解到地球将有大灾难发生。而此时，时空囊预言的两大怪兽·“哥路渣”和“米路巴”先后出现，GUTS小队便根据预言寻找收藏在金字塔的三大巨人的身体。
几经寻找后GUTS队员们终于找到金字塔，但两大怪兽也到来了。虽GUTS拼死守护，但三个巨像已被破坏剩一个，队员·大伍的战机也被击中，且逃生装置失灵。在危急关头，大伍突然化成光，和最后一个的石像结合。光之巨人“迪加”因此而复活，并与两大怪兽展开了战斗……