放暑假前的最后一天，S君没来上学，在家中上吊死了。我明明看到了他的尸体，可尸体消失了，没有人相信我说的话。七天之后，S君居然变成了一只蜘蛛出现在我的面前，声称自己是被人杀死的，而我能帮他做的，就是找到他消失的尸体……
那段日子，猫儿狗儿不见了；那个暑假，我的伙伴离开了；那年夏天，最美的向日葵没有开……

准备在初雪降临之日告别人世的大学生种田静马，来到了位于深山中的栖苅村。在这个“栖苅”大人以蓬莱之琴击败巨龙的地方，他遇到了拥有一只水晶义眼的御陵御影——一位出身侦探世家、年仅十七岁的天才美少女。在这“栖苅”传说之地，她将首次以侦探的身份，投身扑朔迷离的犯罪舞台……

检察官杜丘为人正直，却莫名其妙被人诬告犯有抢劫、强奸罪？！为了洗清自己的冤屈，杜丘一边躲避警察的追捕，一边坚持追查真相——他在北海道山中冒险救下了牧场主的女儿真由美，并和她产生了爱情。
在真由美和他的父亲的帮助下，杜丘拨开重重迷雾，冲破种种险阻，在一家精神病院找到了线索。为了弄清真相，杜丘也装病住进这家医院……
上天入地、奔马巷战……杜丘终于使真相大白于天下！但是，仅仅找到真相，正义就可以被伸张了吗？