1999年、館山市からある物がトラックによって運び出された。その数日後、台風と共にゴジラが館山に上陸。対特殊生物自衛隊＝通称「特生自衛隊」（JXSDF・Japan Counter-Xenomorph Self Defence Force）はゴジラ迎撃を開始するが、全く歯が立たない。
その戦渦、特生自衛隊員・家城茜は操縦するメーサー殺獣光線車を仲間の車両に激突させ、崖下に転落させてしまい、その車両は無残にもゴジラに踏み潰されてしまう。命は何とか助かったものの、茜は仲間を死に追いやったという自責の念を拭い去ることが出来ないまま、責任を問われる形で資料課への転属を命じられる。
一方、日本政府は柘植真智子首相指揮の下、湯原徳光ら日本有数の科学者達を招集して対G兵器の開発に着手、館山沖から引揚げられた初代ゴジラの骨格を基に、4年の月日を経て遂に機龍《メカゴジラ》を完成させた。そして柘植首相は辞職し、科学技術庁長官だった五十嵐隼人が新首相に就任する。
時を同じくして、いまだ心にさまざまな葛藤を残している茜の機龍隊への配属が決定、機龍のオペレーターに任命される。
そして機龍のテスト機動が開始されたとき、ゴジラが東京湾に出現。茜を含む機龍隊は機龍を発進させ、ゴジラに向かう。
ゴジラは横浜・八景島に上陸し、その前に機龍が立ちはだかる。機龍はロケット弾とメーサーで徐々にゴジラを追いつめ「アブソリュート・ゼロ」でとどめを狙う。しかしゴジラが天に向かって咆哮すると、機龍がコントロール不能に陥ってしまう。その隙にゴジラは海中へと姿を消す。しらさぎが機龍を回収し帰還しようとしたところ、突然機龍がまるで意志を持ったかのように動き出し街を破壊し始める。ゴジラの声が機龍のコンピューターに干渉し、初代ゴジラの意識が目覚めてしまったのだ。目が赤く染まり、「本物のゴジラ」の如く猛威を振るう機龍を止めるには体内のエネルギーが尽きるのを待つしかなかった。
機龍の暴走で八景島周辺は全壊。プロジェクトの総責任者である五十嵐にも責任を問う声が高まり、機龍隊の存続も危ぶまれる。湯原は機龍のDNAコンピュータの塩基構造を変えることでゴジラからの干渉を回避させるよう改良を施す。しかし五十嵐は再び暴走するのではないかと恐れ、出動許可を下さないでいた。また湯原の娘・沙羅も、初代ゴジラの骨から作られた機龍が、本来同族でもあるはずのゴジラを倒すことに疑問を感じ始める。
東京湾から再びゴジラが出現する。特自の攻撃をものともしないゴジラは品川に上陸し、市街地を火の海へと変えていく。この事態に五十嵐は、ついに機龍出動を決断する。人類の希望を背負って機龍は飛び立つ。
ゴジラを倒すべく品川の街に降り立つ機龍。決死の覚悟で戦いを挑む茜。機龍、そして茜の戦いがここに始まる。

『BAD GUY BEACH』（バッド ガイ ビーチ）は、1995年公開の日本映画。「新宿鮫」シリーズで知られる大沢在昌の連作小説『悪人海岸探偵局』を原作に、哀川翔が初監督（“あいかわ翔”名義）し、主演も兼ねたハードボイルド作品。本作で対照的な二人のヒロイン役を演じた藤原紀香と麻生久美子は、共にこれが女優デビュー作。そしてバナナマン結成して間もない頃の日村勇紀が、事件に大きく関わる若きカリスマゲームクリエイター役を怪演。

古代大和國誕下雙胞胎，古代傳說雙胞胎的二子是不祥物，被國師把二王子丟去山谷，但被天之白禽所救，並帶他到伊勢神社由巫女扶養他及由青龍玄武兩位傳授武學，少年時在好奇心驅使下到了禁地，海神賜勾玉给他作護身符，長大後，母親召他回國，但母親生了怪病，在探病時把彎玉交給他母親，但晚上母親就過世了，大王子看見彎玉，以為是二王子咒死母親，便找二王子報仇，但混戰中，二王子突然眼晴放出熱線，意外殺了大王子。
父王僧恨二王子便要他前往征服熊襲王，路上和青龍玄武一起，在神社巧遇命中註定的伴侶。於是又一起同行，但不幸弟橘到熊襲國做間碟時被捉住，成為了熊襲神的貢品,另一方面二王子打敗熊襲王後就與熊襲神打鬥救去弟橘，最後用熱線眼打敗熊襲神，獲得白禽之鏡。
返回國後，受養母要求下偷走天叢雲劍，途中再與弟橘一起，但國師居然出現，用咒術召喚海神殺死他們，弟橘眼見王子被海神拉到水底便不惜跳海救王子，王子救了，但弟橘被海神捉走，王子到處找弟橘，在沙灘上居然看到養母暈了，便背著她走了，怎料養母是師所扮，更在混戰中把王子殺了偷去天叢雲劍，負傷的國師將天叢雲劍傳到降臨在月亮的黑暗神後就死了變回牙齒。
當王子醒來時，居然回到年少時的禁地見牛頭大王，他們打鬥時，王子把石中蛇的韓鋤剣拔出，得到神劍，海神把弟橘復活,要他們打敗黑暗神拯救世界。兩人被送到月球，與黑暗神大戰，但不敵，後來用白禽之鏡提升彎玉力量才打敗，黑暗神只好現出真身，化為八歧大蛇在月面上暴走，天之白禽出現救了他們，但八歧大蛇太強，用火焰燒死白禽和他們，死後到了異空間，弟橘代為光包住王子，集合白禽之鏡和韓鋤剣竞變身成宇宙戰神，最後打敗八歧大蛇把他封印，他們便過著快樂日子。

松本よき子は東京の旅行会社に勤める27歳。仕事はできるのだが、いつも野暮ったいメガネに服装でまったく男にモテない。母が死んでから16年後、父・伸之がなんと自分より若い22歳の女・珠美と再婚した。しかも、珠美はよき子と対照的に美人でファッション・センスも抜群のイイ女。妹の燿子までもが、自分と違う目で珠美を見ている。そんなときよき子にもボーイフレンドができた。広野宮彦といい、珠美のかつての恋人の友人で、大学では遺伝子工学を研究しているエリート。ハンサムだが、ちょっと竪物なのだ。よき子も会社では同僚に若い女の子たちから「ハイミス」などと陰口をたたかれていたが、生まれて初めてのデートを経験してからは、少しずつ服装や化粧にも気を使うようになってきた。デートを重ねるごとに親密さを増す2人だったが、よき子は珠美のボーイフレンドからの電話で広野のいい加減さを知ってしまう。珠美は逆に家庭に入ったため遊びに行けず欲求不満は高まるばかり。しばしばよき子と衝突するようになった。よき子は広野に失望し、着飾ることをやめて野暮ったいが、自分らしい自分へ戻っていく。しかし、家では父や妹からも邪魔者扱いされ、よき子はひとり夜の街を飲み歩いた。そして、自分だけのアパートを借りて、新しい生活を始める決心をするのだった。

松本よき子は、「ブス」のレッテルを貼られているバリバリのオフィスレディ。ある日、父の再婚相手から青年を紹介されたが、異性に縁のない堅物男だった。次第にデートを重ねるようになったが……

The U.N.G.C.C. (United Nations Godzilla Countermeasure Center) recovers the remains of Mecha-King Ghidorah and construct Mechagodzilla as a countermeasure against Godzilla. Meanwhile, a giant egg is discovered along with a new monster called Rodan. The egg is soon found to be none other than an infant Godzillasaurus.

Startup - Resonance - Smashed Ice.

JSDF pilot Akane has a fateful encounter when a new Godzilla emerges in Tateyama. As a countermeasure, a cyborg named Kiryu is constructed from the remains of the original. The machine is discovered to harbor the restless soul of the original monster as Akane must learn to find value in her own life as well.

Humanity finally rids themselves of Godzilla, imprisoning him in an icy tomb in the South Pole. All is peaceful until various monsters emerge to lay waste to Earth's cities. Overwhelmed, humanity is seemingly saved by a race of benevolent aliens known as Xiliens. But not all is what it seems with these bizarre visitors. If humanity wishes to survive, they must reluctantly resurrect their most hated enemy, Godzilla.