1997 年放送のシリーズに関わっていたスタッフを迎え、サトシとピカチュウの「いつもの、特別な一日」を描く、年内最後の放送にぴったりなスペシャルエピソードとなっています。

Yoko Asagiri is in love, but is afraid to confess her feelings so she writes a song to express her feelings. Much to her dismay, the love song she wrote acted as a bridge connecting the world in which she lived in to that of Earth's alternate world called "Ashanti." There, the ruler of that world wants her song so that he could use it to open a doorway to Yoko's world and conquer it with his armies. Using the artifacts left behind by the legendary warrior Leda who prophesized her arrival, Yoko and her newfound friends must stop the tyrant's ambition and return both worlds to their proper place and balance.

2000 anime film directed by Kunihiko Yuyama

2001年，表面繁荣的国际社会的内侧，实际存在着暗中掌控着全世界的邪恶秘密组织“毒牙”，他们邀请发现了特殊能源比姆拉的真田博士加入，而真田博士则选择了牺牲自己保护比姆拉的秘密。

在那之后，毒牙把魔爪伸向了真田博士的儿子健太，危机关头，神秘光头萨哈拉斯率领的古德闪电部队保护了健太，他们搭乘以比姆拉为能源的古德闪电一次又一次展开空间跳跃之旅，而为了夺取比姆拉，毒牙也对他们展开了追击。

创圣纪0011年的地球，由于11年前的大异变，人类丧失了2/3的人口。
南极冰山溶化，1万2千年前灭亡的亚特兰蒂亚重现于世，拥有双翼的「堕天翅族」苏醒了。他们将生物机械兵器「神话兽」接连送入人类的都市，捕获人类，摄取生体能源「Purana」。
另一方面，人类决心反击，从海底遗迹发掘岀三台组合（hybrid）战斗机「Vector Machine」。这是1万2千年前，将堕天翅族逼入灭亡绝境的传说中的兵器。Vector Machine经过合体，「机械天使Aquarion」即将现身。
要启动Aquarion，需要能与机体的机械生命感应和共鸣，称为「Element」的人。这要求特别敏锐的五感和纯真的灵魂，因此十五岁左右的少年少女们被选为机师，集中起来。
而后，「机械天使Aquarion」合体的时刻终于到来…