“光子电池”是拯救资源枯竭的地球的能源。为了前往地球上无法制造的能源装置的供给源地，贝尔利·杰纳姆、艾达·休冈等人乘坐梅格法纳离开地球圈，终于到达了目的地金星地球圈。经过与正在策划地球回归行动的基特团的战斗后，艾达得到了与垄断“光子电池”生产和供给的“赫尔墨斯财团”的拉·古总裁的会谈机会……

　オリジナルのＴＶシリーズ全50話に新作カットを追加し、新解釈でブラッシュアップした劇場版シリーズ第２弾。いよいよ新型モビルスーツ“Ｚガンダム”が登場し、地球と宇宙を跨いだ戦乱の局面へ突入。カミーユとフォウの運命的な出会いを中心に、第三勢力も交えた壮絶な戦いが繰り広げられていく。
　宇宙世紀0087年、カミーユが参加した反地球連邦組織エゥーゴと連邦軍のエリート組織ティターンズの内戦は相譲らず、激化の一途を辿っていた。そんな中、地球に残っていたカミーユは神秘的な女性フォウ・ムラサメと出会う。彼女に運命的なものを感じたカミーユ。しかし、実はフォウはティターンズの強化人間だったため、２人は哀しき宿命へいざなわれていく。やがて宇宙に戻ったカミーユは新型モビルスーツＺガンダムに搭乗し、混沌の戦場へ。また一方では、新たな勢力である旧ジオン軍の残党アクシズが台頭していた…。

位于圣波尔图的亚美利安飞船突然遭到袭击，这是因为太空殖民国家托瓦桑格启动了旨在重返地球的“Reconguista”行动。地球内外的四大势力聚集在圣波尔图，每个力量都主张自己的权利并提出意见时，艾达决心寻求真相，并决定与贝尔利和朋友们一起前往托瓦桑加。在月球背面的托瓦桑格，贝尔利和艾达发现了一个令人震惊的真相……

载着贝鲁利等人的米加法乌纳追赶吉特团从维纳斯·格罗布出发。但是，地球圈的战况已经完全改变了。在大气层外对峙的Capital Armiy和Ameria军队、Dolet舰队在禁忌存在的Casheba Mikoshi附近反复发生更激烈的冲突。在那漩涡中，贝鲁利想要消除战争产生的悲剧和憎恨，知道人类危机的姐姐艾达将目光转向了新的时代。但是，随着资本阿米与吉特团共同战斗，由米加法乌纳带来的新战斗力增强的阿米利亚军队与德雷特舰队联手，使宇宙战舰沉没的惊人的莫比尔套装群将陆续投入战场。激化，吞噬无数人命的宙域。然后，各势力被地球的重力所吸引，最终决战进入大气层内。站在大地上的G-Self，现在正引导着贝鲁利走向漫长旅途的终点……

　ＴＶシリーズに新作画パートを加え、新解釈の三部作として劇場版へと昇華した人気ＳＦロボットアニメの完結編。連邦軍同士の内戦に２つの勢力が割って入り、それぞれの思惑を胸に熾烈な総力戦を繰り広げていくさまを、デジタル技術を駆使したスピード感溢れるタッチで描く。
　地球圏での戦乱が混迷を極めている宇宙世紀0087年。カミーユ、シャアらの反地球連邦組織エゥーゴは、連邦軍のエリート組織ティターンズと激しい攻防戦を展開していた。さらに、自軍のティターンズを掌握せんと目論む木星輸送船ジュピトリスの指揮官パプテマス・シロッコ、そしてザビ家の復興を掲げる旧ジオン軍残党アクシズの指導者ハマーン・カーンまでもがこの激戦に絡み合う。こうして彼らは、地球圏を制するための重要拠点、巨大レーザー砲に改造されたスペースコロニーのグリプス２を巡り、未曾有の最終局面へと向かっていく…。