《混沌生物学》是把生物学与混沌结合起来这一前沿领域的第一本论著，系统的阐述了国内外与生物科学相关的混沌研究的最新理论及其发展趋势。并且，对生物学中迷惑不解的许多现象，给出了深刻而全新的解释。对生物医学一些传统理论提出跳战，为疾病的预防和治疗提出了新机理和方法。同时，还简要介绍了混沌控制的机制和方法以及生物学意义。初版问世已经5年，相关领域又有很大发展，为反映国内外研究成果及新进展，拟对原书进行全面修订和改编，一些章节将进行重写或改写。全书共三大部分：第一部分为非线性和混沌的基本理论，第二部分为混沌在生物及相关领域交叉研究和应用，第三部分为混沌控制。由于非线性科学用到的数学相对较难，为了分散难点，循序渐进，于易理解，在章节上并未将各大部分严格划分，而是有所穿插，使其具有可读行性。

最近在生命科学中取得的进展，已经在我们对自然的认识方面产生了意义深远的影响。对远离平衡态的非线性系统和自组织的深入研究，已被纳入科学视界。因分子生物学领域的卓越贡献而著称的克拉默教授，以其独特的洞见致力于展现一幅整体图景，回答长期以来一直强烈吸引着人类的重大问题——生命是什么。
克拉默教授探究了耗散结构理论、超循环理论、混沌理论和突变论等自组织理论，剖析了生命结构的有序与混沌，基因治疗的可行性，物种进化和进化主义，树与闪电的相似形态，三体问题，天体结构，分形艺术，大爆炸，衰老与死亡，由此建立了事物的根本复杂性的概念和相关理论。
本书每一章皆以一段哲理性对话开篇，以一首抒情诗作结，旨在以这种别出心裁的结构，架起沟通科学技术与哲学人文“两种文化”的桥梁。

这是作者参加与建立现代复杂经济科学的论文集，跨越了比较历史学、理论生态学、经济动力学、社会心理学和非平衡态物理学等领域，以探讨两大社会科学的基本问题：劳动分工的演化机制和市场经济持续波动的内因。作者从宏观和股市运动的定量分析与历史案例出发，挑战目前均衡经济学与计量经济学的基本模型，发现了有效市场、噪声驱动、理性预期、微观基础等显学的生大谬误，发展的统一的非线性经济演化动力学的一般理论，以理解长至千年的东西方文明分岔、短至几年左右的技术换代与经济波动。

《古代哲学中的信息、系统、复杂性思想:希腊·中国·印度》中写到人类古代浩繁的哲学文献恰如一座全息蕴涵人类古老智慧的思想宝库。其中既有泥土沙石，也有珍珠美玉。当人们从不同的角度、运用不同的方法对其进行挖掘和解读时，便可能会得出十分不同的意见和结论。《古代哲学中的信息、系统、复杂性思想:希腊·中国·印度》所做的工作，是作者从一个特定的角度、运用一种特定的方法对人类古代哲学文献中蕴涵的部分思想的再挖掘和再阐释。

网络科学作为一门新兴的学科越来越引入瞩目。网络科学能帮助读者设计更快、更有弹性的通信网络；能用于调整电力网络、电信网络和飞行航线等基础设施系统；可以为市场动态建模；能帮助理解生物系统中的同步；能用于分析人们之间的社会互动……
这是第一本全面审视新出现的网络科学的论著。书中研究了各种网络——规则网络、随机网络、小世界网络、影响网络、无标度网络和社会网络等，并将网络过程和行为应用于涌现、传染病、同步和风险方面。本书的独特之处在于将跨计算机科学、生物学、物理学、社会网络分析、经济学和市场营销等多学科的专业概念整合了起来。
本书为网络科学领域提供了全新的理解和阐释，是研究人员、专业人员以及工程、计算、生物领域的技术人员不可缺少的参考资料，也可以作为相关领域研究的高年级和研究生教材。

本书的相当大部分致力于对科学理论和模型的表述，从而为进行哲学分析提供素材。由于多体系统的复杂性，诸学科基本上依赖于理想化和近似，各学科部分成了许多强调系统不同假面的模型。我将尽力展开模型。背扣的假设和预设，便于读者评价它们那些通常是有文化影响的声称。除了对一般概念进行澄清，我希望本书可以激起不同领域科学家之间的相互对话，不仅关于他们正在研究什么，还关于他们正在如何进行。因此，我努力使本书的内容易于一般读者理解，把诸学科的概念结构（conceptual struc-tures）尽可能解释清楚，尽量少引用行话，并在每一专业术语第一次出现时予以解释。由于本书的覆盖面很广，我将力求简明，使主要思想凸现出来，而不拘泥于细节。
科学主义过分炫耀科学且背离科学精神，这激起了让许多科学家吃惊的对科学的敌意。祸起萧墙。我们不要仅仅抱怨公众不愿意支持科学研究，或许我们应当检查自己，看看是不是我们做得太过分了，而成了科学主义。
——欧阳莹之

本书是国际著名科学家、诺贝尔获得者普里戈金教授与斯唐热博士合写的一本关于当代自然科学哲学问题的重要著作。本书作者根据自然科学发展的最新成果，特别是耗散结构等非平衡系统自组织理论的新进展，讨论了自然界的可逆性和不可逆性、决定性和随机性、简单和复杂、进化和退化、有序和无序等一系列重要问题，对热力学第二定律作了新的解释，论述了“时间之矢”的意义，总结了近三百年来自然科学发展的历史，提出应把自然科学各个门类，自然科学和人文科学，中国和西方的文化传统结合起来，形成新的科学观和自然观。

协同学：大自然构成的奥秘，ISBN：9787532736379，作者：（德）赫尔曼·哈肯（Hermann Haken）著；凌复华译

At a time of unprecedented expansion in the life sciences, evolution is the one theory that transcends all of biology. Any observation of a living system must ultimately be interpreted in the context of its evolution. Evolutionary change is the consequence of mutation and natural selection, which are two concepts that can be described by mathematical equations.Evolutionary Dynamics is concerned with these equations of life. In this book, Martin Nowak draws on the languages of biology and mathematics to outline the mathematical principles according to which life evolves. His work introduces readers to the powerful yet simple laws that govern the evolution of living systems, no matter how complicated they might seem.
Evolution has become a mathematical theory, Nowak suggests, and any idea of an evolutionary process or mechanism should be studied in the context of the mathematical equations of evolutionary dynamics. His book presents a range of analytical tools that can be used to this end: fitness landscapes, mutation matrices, genomic sequence space, random drift, quasispecies, replicators, the Prisoner's Dilemma, games in finite and infinite populations, evolutionary graph theory, games on grids, evolutionary kaleidoscopes, fractals, and spatial chaos. Nowak then shows how evolutionary dynamics applies to critical real-world problems, including the progression of viral diseases such as AIDS, the virulence of infectious agents, the unpredictable mutations that lead to cancer, the evolution of altruism, and even the evolution of human language. His book makes a clear and compelling case for understanding every living system--and everything that arises as a consequence of living systems--in terms of evolutionary dynamics.

约翰·布里格斯、F.戴维·皮特所著的《湍鉴(浑沌理论与整体性科学导引)》系“ISIS文库·科学与时尚系列”之一，堪称“爱丽丝漫游”非线性科学、复杂性科学“奇境”的史话。作者借助庄子、老子、列子的浑沌和整体性思想，利用紊乱之镜鉴“湍鉴”鉴照神话、童话、诗歌、绘画、小说、艺术、哲学，探讨秩序与浑沌“剪不断、理还乱”之关系，提出老套的还原论科学终将被“紊变与整体性科学”的新范式所取代。非线性、不规则性、不稳定性、不可预测性无处不在，相空间、吸引子、庞加莱猜想、卡姆理论、分形几何栩栩如生，突变、协同、耗散结构、超循环、迭代、反馈、分岔、孤波等概念深入浅出，普里高津、玻姆、马古利斯等“科学异教徒”勇往直前。全书的篇章结构设计，爱丽丝与黄帝互鉴，亦不落俗套，当为一奇。

本书的目标，是要从后现代，或者也许更精确地说是从后结构(post-struct ural)的视角来阐明复杂性概念。从这种视角获得的最明显的结论是，不存在总揽一切的、可忽略掉复杂系统中偶发性方面的复杂性理论。如果某事物的确是复杂的，就不可能从简单理论得到恰当的描述。关注复杂性，必须关注特定的复杂系统。尽管如此，我们还是可以在非常基础的层面上，对复杂行为和复杂系统动力学的条件进行一般性说明。而且我还认为，可以对复杂系统进行建模。模型可以在计算上执行，并可能导致可以执行更复杂任务的机器。不过，模型本身将至少与被建模的系统同样复杂，因此不可能导致我们对于系统本身理解的任何简化。作为这种模型的一个例子，我广泛地使用了神经网络，即一种称作联结论的趋法。事实上本书通过指出神经网络的运行与德里达的语言工作的描述之间具有结构相似性，来理解后现代理论对于复杂性研究的意义。

复杂性科学是可与相对论、量子力学媲美的20世纪重大科学突破之一。在某种意义上，复杂性对整个科学体系的影响，也许比后两者更深刻、更广泛。进入21世纪，探索和理解复杂性，依然受到自然、社会、人文等各学科的共同关注。德国著名哲学家、复杂性科学专家克劳斯o迈因策尔教授的这本名著已出至第五版，它从哲学的高度，广泛涉猎物理学、生命科学、认知科学、计算机科学、经济学、社会学等诸多方面，揭示了不同学科体现出的共同的复杂性特征，以详尽而不失之繁琐的例证，和严谨而又尽可能通俗的笔法，阐释了对复杂性的探索将如何引起人们思维方式的深刻变化。
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生命最伟大的奇观体现在单个细胞(受精卵)发育成数十亿乃至数万亿个细胞而组建动物的过程。长久以来，科学家们就知道，要是能够阐明胚胎中形态和模式图案如何出现的话，他们就能够清楚地理解今天令人惊叹的动物界的多样性是怎样从5亿年前的原始形态演化而来的。在《无尽之形最美(动物建造和演化的奥秘)》中，著名生物学家肖恩·卡罗尔，演化发育生物学开创者之一，为广大读者打开了令人振奋的崭新生物学分支一一演化发育生物学的黑匣子，展示了这场令人叹为观止的科学革命。书中详细叙述了各种各样的动物，包括我们人类本身是如何建造的以及它们的分子遗传基础。《无尽之形最美(动物建造和演化的奥秘)》的英文版出版后获得一致好评，荣获多项奖励，如美国《发现》杂志和《今日美国》报等的科技图书年度奖。

In a rented convent in Santa Fe, a revolution has been brewing. The activists are not anarchists, but rather Nobel Laureates in physics and economics such as Murray Gell-Mann and Kenneth Arrow, and pony-tailed graduate students, mathematicians, and computer scientists down from Los Alamos. They've formed an iconoclastic think tank called the Santa Fe Institute, and their radical idea is to create a new science called complexity. These mavericks from academe share a deep impatience with the kind of linear, reductionist thinking that has dominated science since the time of Newton. Instead, they are gathering novel ideas about interconnectedness, coevolution, chaos, structure, and order - and they're forging them into an entirely new, unified way of thinking about nature, human social behavior, life, and the universe itself. They want to know how a primordial soup of simple molecules managed to turn itself into the first living cell - and what the origin of life some four billion years ago can tell us about the process of technological innovation today. They want to know why ancient ecosystems often remained stable for millions of years, only to vanish in a geological instant - and what such events have to do with the sudden collapse of Soviet communism in the late 1980s. They want to know why the economy can behave in unpredictable ways that economists can't explain - and how the random process of Darwinian natural selection managed to produce such wonderfully intricate structures as the eye and the kidney. Above all, they want to know how the universe manages to bring forth complex structures such as galaxies, stars, planets, bacteria, plants, animals, and brains. There are commonthreads in all of these queries, and these Santa Fe scientists seek to understand them. Complexity is their story: the messy, funny, human story of how science really happens. Here is the tale of Brian Arthur, the Belfast-born economist who stubbornly pushed his theories of economic ch

作为当代卓越的量子物理学家与最为活跃的科学思想家，玻姆在《整体性与隐缠序：卷展中的宇宙与意识》中发展了一种量子理论，把存在作为一个未破缺的整体（包括物质与精神）来处理。作者从理论的科学背景出发，进而质疑语言在破碎性的哲学思维中所起的作用，并提出我们关于宇宙与实在的观念本身是这个未破缺整体中的一个发展着的部分。他引入了隐缠序的观念，即，任何相对独立要素的内容，都包含着一切要素（即存在总体）的总和，犹如一张折叠纸的接触点可以包含着纸展开时所展示的总图像的实质一样。隐缠序可以对量子理论所隐含的物质新属性，对意识的能动性以及意识与物质的关系，给出一致性的说明。

《形式综合论》(Notes On The Synthesis of Form)是亚历山大最重要且最常被引用的著作之一,该书奠定了亚历山大一生学术工作的基础,同时也是之后兴起的寻求设计方法运动的基本读本之一。
在书的第一部分，亚历山大讨论了形式因背景而生，而环境背景的出现根本是为了满足人类的需要这一过程。他表明，这种自适应的过程只有在逐步推进的情况下才能成功实现，而不是一蹴而就。因为，形式产生于传统的非自我意识的文化，不是由设计师创造的，而是经由传统格局的缓慢变化成型，其形成和适应过程非常优美。而在我们自我意识的文化中，一个设计师应背景需要去创造一种形式，是失败的，因为，先入为主的概念导致他为解决问题而构建的图像与实际问题的内在组成并不相符，因此只会导致随意性、任意性、缺乏实际了解，困扰现代建筑和现代城市的设计。
在第二部分中，亚历山大提出的方法是，设计人员可以充分发挥自己创造性的想象力，但要避免不相干的成见的陷阱。他表明，每当面临一个问题，都可以忽略现有的概念并通过问题本身的结构创造出新的概念，以正确符合他所提出的自适应过程的子系统。把每一个这样的子系统当做一个子问题来处理，设计人员可以将新的概念转化为形式。因为这个过程，该形式会非任意性地、正确地适应它的背景和内容。

本书是诺贝尔经济学奖得主司马贺的代表作之一，是1996年修订出版的第三版的中译本。第三版增加了全新的一章“复杂性面面观”，修改了文字内容并更新了部分数据。
作者率先构造出“人工科学”的概念，据以将经济学、思维心理学、学习科学、设计科学、管理学、复杂性研究等领域贯穿联系起来，使人获得很多启迪。本书对传统思维提出挑战，指出人工智能所期望达到的领域，揭示了人工性和层级对于复杂性的意义，从多个领域说明人工科学何以是可能的，并试图说明它的性质。本书的基本主题是：物质符号系统具备必要和充分的手段来采取智能行动。

《分形城市系统:标度•对称•空间复杂性》的主要内容是基于对称思想和标度概念建立城市系统的理论模型，以期反映城市演化及其时空结构的一般规律。根据维数与空间的对应性，从时间、空间和等级三个角度将地理空间分为三种类型。基于三类空间，从宏观城市层面发展了刻画城市系统的标度定律，揭示城市系统演化现象背后的简单与复杂的数学联系和物理本质。
城市和城市体系是复杂的空间系统，分形是探索复杂性的有效工具。运用分形思想探索城市系统的空间复杂性具有重要的理论意义和实践价值。

《广义哈密顿系统理论及其应用(第2版)》在第一版的基础上修订再版，除了对原有内容作了修订外，还增加了广义哈密顿系统与微分差分方程的周期解、广义哈密顿系统的KAM理论、经典Hamilton系统的Leibniz流形上的向量场、恰当Poisson结构等新内容。《广义哈密顿系统理论及其应用(第2版)》采用广义Poisson括号（实际上是Lie群、Lie代数）的方法，系统论述了广义Hamilton系统及其扰动系统的理论及应用，内容自相包含，理论与应用兼顾，便于读者阅读。《广义哈密顿系统理论及其应用(第2版)》可供大学数学系、物理系、力学系及工程领域有关科系的学生、研究生、教师以及有关的科技工作者参考。

本书是首部全面、清晰且令人易于理解地阐述复杂适应社会系统的著作，由该领域两位权威学者联袂完成。复杂适应社会系统——不论是“政治党派”、“股票市场”，还是蚂蚁群落——都体现了社会科学在理论上与实践上所面临的一些最有趣的挑战。通过引人入胜的文字描述和难易适中且附有直观解释的技术细节，本书着重介绍了自20世纪90年代中期以来在该领域出现的关键工具与思想，以及研究此类系统所需要的支撑技术。本书详细介绍了一些相关概念，比如涌现性、自组织临界性、自动机、网络、多样性、适应性以及反馈等。它还展示了如何利用从数学到适应性主体计算模型等一系列广泛的方法来探索复杂适应系统。