头部两侧各有类似猫耳的角，被称为二觭人（ディクロニウス）的女性变异人(新人类或超能力者)，因为具有毁灭人类的力量，位于日本神奈川县镰仓市外海的离岛上的国立生态研究所，便机密地将这些女孩隔离起来并加以研究。
某日，研究所内发生了重大的意外事故。原本被隔离的二觭人少女-露西，因为不明人士的暗中帮忙，得以突破拘束装置，并分尸了所内23位武装警卫[4]，连研究所室长-藏间的女秘书-如月都惨遭杀害。虽然狙击手以穿甲弹瞄准她的头部开枪，却仅击破其铁头盔；露西虽然头部受伤流血并坠入海中，仍得以幸存并成功逃亡。
事件发生的次日，为了读大学而前往镰仓找亲戚帮忙的青年-耕太，和年幼玩伴的堂妹-由香久别重逢。相偕出游至充满回忆的海滨，碰上了因头部受伤故造成另一个人格取而代之的露西；她只会发出“にゅう”的声音，因此被取名为妮悠（Nyu）。妮悠对于自己是使人类灭亡的存在一事完全无知，耕太和由香两人便决定带到他们居住处的“枫庄”暂时定居下来。
此时，研究所出动了SAT（特殊突击部队）欲猎杀逃走的露西，SAT的队员-坂东在海岸边发现了人格转换的妮悠。原本任务即将成功，却因为妮悠恢复了露西的人格，与坂东同行的队员全数遭杀害，仅存战败后身受重伤（失去右臂与双眼）的坂东一人。誓言对露西复仇的他，借由研究所的科学技术重新复活，后来逃出研究所、脱离SAT并回到镰仓，不择手段地搜寻露西的下落。
隔天，妮悠在清扫走廊时不小心跌倒撞倒头部，受到冲击而在枫庄恢复了露西的人格。当她正打算杀死耕太时，脑中突然浮现一个少年拼死命叫她住手的画面，因此放弃杀掉耕太的念头。其实那个少年就是8年前的耕太。
随后，在研究所同样身为变异人的少女娜娜找上了露西，准备将她带回研究所，两人谈判破裂后展开了战斗。对战的结果，娜娜的双手与双脚惨遭截断而失败，不过她成功将露西的“手”能力暂时封印（在施展“手”的脑部重要器官上给予一些损害）。
到了后来，离家出走的少女真由、被抛弃的小狗汪太，以及本应该被处死但被蔵间室长从研究所放出来的娜娜，大家都因为耕太的接纳而纷纷来到枫庄居住下来。接纳了素昧平生的女孩以及个性温顺的变异人少女，发生在枫庄的奇妙同居生活就这样展开了。
在真由、汪太和娜娜加入枫庄之前，耕太曾因为大学里的角泽教授的一番话所压迫，不得已将妮悠交由角泽教授处理；但耕太无论如何无法接受妮悠被带走的事实，稍后返回大学欲和教授交涉。接着，在地下室的研究室中，耕太和研究助手荒川一起发现角泽教授被惨杀的尸体，并且被荒川交代要当作没遇到这件事情。耕太精神恍惚地离开研究室，而当时妮悠已经不知去向（后来是在神社的台阶处找到妮悠）。
藏间室长帮助娜娜逃离的单独行动被知道后，角泽长官将所有变异人中被称为最强的年幼女孩，其真实身份为藏间室长亲生女儿的真理子给解放，准备出动她对抗露西，并借此做为对藏间室长的背叛行为的惩罚。
耕太在和妮悠、娜娜等变异人少女的相处下，原本封印起来的那段发生在8年前的镰仓的悲惨事件，开始逐渐回忆起来。而极欲捕捉露西的角泽长官，以及欲找露西报复的坂东，这些势力的行动正慢慢地让枫庄原本平稳的生活遭到破坏……
在没有任何背景知识和没有“剧情透露”的情况下观赏本作，会认为这是个集合怪异风格、耍萌、性爱、暴力、血腥等特性，感觉混沌不清的作品，这是多数人很容易有的想法。
关于漫画的部分，在初期发表时被读者给予“构图和设计稍嫌拙劣”的印象，因为听到此风评而先入为主讨厌本作风格的倾向也是存在的。然而，因为获得许多支持者“只要读过一次就会改观并且深陷其中”的评价，使得本作品具备了独特的自我魅力。举出一个例子，明明似乎是一个地位相当重要的角色，却在刚翻到下一页后，发现该角色瞬间被杀死了… 像这类的剧情发展在故事中可谓大量存在，而之后的发展无论是好是坏，都由一些完全无法理解的事情来展现出来。（作者和当时负责监督的编辑，对于讨论故事发展的协商动作是全盘皆无的，仅是判断每周新出的连载篇名是否有趣而已，这被认为是其中一个原因。）
虽然并不怎么被谈论到，不过动画版在音效方面的表现也是十分讲究，而且堪称煞费苦心。特别是于残酷虐杀场景中所使用的，像是骨头碎裂的声音和肉体被切断的声音，这些声音结合起来所呈现的音效，对于本作拥有的特异风格而言，在效果上起了加分作用（本作的音效在动画版‘血战’（BLOOD+）与‘暮蝉悲鸣时’（ひぐらしのなく顷に）中有疑似被利用的现象）。
无论漫画原著或者动画版，同样都是以日本神奈川县的镰仓市为中心点来设定故事舞台。尤其是动画版，和监督神户守的另一部动画作品‘彗星公主’[1]（此作品同样以镰仓市做为故事背景）相较，一般认为大致上有相同的“场景搜索”表现[2]，镰仓市内实际存在的神社、海岸、江之岛电铁等场景，都在作品当中登场。
在周刊少年Jump的结尾评论中，从“因为太贫穷而买不起电视…”（极贫でテレビが买えません…）、“一个人在马达加斯加…”（一人でマダガスカル…）之类的谦虚评论可看到的人物像中，另外特别是在网络上的主要支持者之间，不管作者是男儿身这件事，大家都以“小阿伦”（伦たん）来亲切地称呼他。“本漫画不只是剧中的角色，连作者本身都很萌。”因为这样的评论，而让本作得到许多人气度。
知名漫画家冨樫义博也是本作品的影迷，这件事是经由其妻子武内直子而得知的，有传言指出，这对于冨樫在‘HUNTER X HUNTER’的NGL篇的创作上造成了相当巨大的影响力。
本作品在日本当地是属于知名度不高，只有少部分人非常清楚的作品[3]（知道的就知道，不知道的就不知道）；然而在海外地区，本作的特异风格和女主角的强大力量广泛受到欢迎，具有非常高的人气度。
在2004年的“AnimeReactor Community Awards”当中，本作品获得 最佳OP/ED组合、最佳剧本、最佳惊悚片(神秘+恐怖)、最佳影迷服务 等数项荣誉，而女主角露西也荣获最佳女性角色奖。此外，2007年在美国纽约Comic-Con(初回)的“American Anime Awards”当中，本作品也获得“最佳短篇系列”的提名（总共有5个作品被提名，但本作最后并没有得奖）。
本作有一个特色，即完整全名有被交代的角色极端稀少，关于这件事，作者有提到这是为了对《亚基拉》致敬
